根據防潮及防水程度的不同，一般把防水瓦楞紙箱分為疏水型、擋水型及耐水型紙箱三大類。

    疏水型瓦楞紙箱防水能力很弱，可做暫時性防水使用，主要是在紙箱表面涂布蠟或硅油等制得，遇到一次大量的水，或長時間和水接觸時，疏水加工面的防水效果會完全喪失。

    原紙生產時，在紙漿中加入抗水劑或在紙張表面進行施膠處理，以使瓦楞原紙獲得疏水性。另外，也可以通過涂布機對紙箱內外表面進行抗水劑的涂布。

    當然，根據使用的要求不同，可以對紙箱內表面或外表面進行防水處理。使用中，由于經過了表面涂布加工，紙箱的耐磨性提高，可減少流通中紙箱表面脫皮和產生紙末的現象。由于防水效果較差，在反復流通，如多次進出冷庫后，紙箱疏水能力不斷下降，終防水能力與普通紙箱相同。

    防水防潮紙箱主要應用在冷凍食品及需要低溫保鮮的產品，新鮮水果蔬菜的保鮮運輸也可以使用，國外也有直接應用在鮮活魚運輸包裝的防水紙箱。

    同時，冷凍商品的包裝為保持箱內環境的低溫，防止產品解凍，一般還對紙箱進行保溫處理，如加裝隔熱層。

    紙箱出冷庫后，一旦暴露于常溫下，溫差的存在使紙箱內外凝結水珠，如果紙箱沒有防水處理，水分的滲入會使破壞紙箱強度，使其保護性能變差。

    水蒸汽或水接觸擋水型瓦楞紙箱表面時幾乎不被吸收。其擋水性能也主要采用涂布，以石蠟為主的樹脂或瀝青乳液獲得。也可以在紙箱表面覆膜或使用淋膜紙生產紙箱，如果紙箱兩面都進行涂布處理，則擋水性更好。